1996年开始了自己的执教生涯。
2000年开始执教意大利第六级别球队桑索维诺。执教期间，他为球队准备了33套定位球的进攻方案，因此获得了“33大师”的昵称。此后执教过佩斯卡拉、阿雷佐、阿韦利诺、维罗纳、佩鲁贾等球队。
2005年萨里与佩斯卡拉队签约，这是他第一次执教意乙球队。
2012年萨里开始执教恩波利，首个赛季就率队获得意乙第四名，但在升级附加赛中失败。2013-14赛季他率领恩波利获得意乙第二名直接升级。2014年夏天恩波利并没有什么大手笔引援，而萨里又是首次征战意甲，因此不被人们看好，但2014-15赛季在萨里的执教下恩波利却成为最大黑马，他们取得8胜18平12负的成绩早早保级。
2015年夏天萨里开始执教那不勒斯。萨里在那不勒斯执教三年，率领球队两次夺得意甲联赛亚军。并在2017年他曾被评为意甲年度最佳教练。
2018年5月24日，萨里卸任那不勒斯主教练职务。7月14日，切尔西官方宣布正式任命萨里为球队主教练，双方签约三年。2018-19赛季，尽管萨里率领切尔西赢得了欧洲联赛的冠军，但萨里依然遭到了部分球迷和媒体的不满，最终他选择与切尔西解约。9月16日，在英超第五轮的比赛中，萨里率领的切尔西4-1逆转战胜了卡迪夫城，收获了五连胜，成为第四位首次在英超执教便取得五连胜的教练。
2019年6月16日，尤文图斯宣布萨里成为球队主教练。双方签约三年，年薪达600万欧元。
2020年2月17日，尤文图斯2-0主场战胜布雷西亚，此役过后，萨里在执教尤文的前17个主场比赛中赢下16场，成为自1960年卡罗-帕罗拉之后尤文图斯队史第二位在各项赛事前17场主场比赛赢下16场的教练。7月27日，毛里奇奥·萨里带领尤文图斯足球俱乐部提前两轮夺得2019-20赛季意甲冠军，这也是他教练生涯的首个意甲冠军。
北京时间2020年8月8日凌晨，尤文图斯在欧冠1/8决赛中被里昂淘汰出局，其后，尤文图斯官方宣布，解雇主教练萨里。
2021年6月，萨里出任拉齐奥主教练。
2022年6月3日消息，拉齐奥俱乐部官方宣布，与主帅萨里续约至2025年。
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